毛细管电泳是一类以毛细管为分离通道、以高压直流电场为驱动力的新型液相分离技术。毛细管电泳实际上包含电泳、色谱及其交叉内容，它使分析化学得以从微升水平进入纳升水平，并使单细胞分析，乃至单分子分析成为可能。
电流不稳定？基线玩漂移?谱图没有峰只有“包”？怎么办？
换缓冲液。
换个干净的磨口瓶重新配置一份缓冲液，超声15分钟，换个新的注射器和滤头，再制备一份缓冲液进样，好多时候你会发现基线又重新走成直线了。
换样品。
蛋白放久了会变性，有的高分子时间稍久会聚集，还有的样品容易和管壁发生吸附。遇到这些情况就要考虑重新配样品了，有时样品很贵还要割爱呦！还有一种情况就是样品纯度达不到要求，比如生化纯的样品用毛细管电泳跑出来两个峰的情况很正常。
换管子。
电泳又“current leakage”了，冲洗很久也没解决问题怎么办？这个时候就要拆下毛细管看是不是管子已经断了，尤其要注意检测窗口这个整根管子的最薄弱环节。
换瓶塞。
瓶塞老化后会变硬，电极在插入样品瓶时若戳在硬塞子上就很容易折弯，还有就是塞子与瓶子不配套时也会有同样的后果。塞子上残留的液体还会引起电流泄漏和压力加不上去的问题。
洗柱子：样品出峰时间逐渐延长，前后两针的峰面积差许多，或者是峰形一下变得惨不忍睹了怎么办？
用强的冲洗条件(比如高浓度的碱，延长冲洗时间，甚至提高冲洗时的柱温等)冲下柱子吧，好多时候都会有效的。冲洗之后最好用缓冲液多平衡一些时间，毕竟管子表面的荷电情况相当于重新“洗牌”了呀！
洗电极。
beckman的机器的电极是裸露在外面的，有些样品(尤其是生化样品)很容易在电极上发生吸附，还有的盐分会在电极上析出，这些都会使重现性变差。找一些干净的湿酒精棉布擦一下就可以了，忌用纸巾免得引入新的污染源-纤维。
洗瓶子。
瓶子里残留的少量可溶性杂质也会对分离产生影响。有一次瓶子没洗干净就匆忙进样了，结果连基线都跑不平，折腾了小半天才发现几乎每个瓶子的瓶口都有一圈若隐若现的白圈(洗洁精的残留物)。
重新把瓶子超声烘干重新过滤缓冲，在上机器基线就又平稳了。
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